这也是让他注重重塑天然材料的机会。传统的日式建筑非常关注节奏和轻盈感，但在现代建筑中采用天然材料达到这个高度则会限制你的材料搭配。因此，隈研吾开始采用如石头一般的材料，将它们当做轻盈的木材或玻璃，将材料切成薄片并作为粒子来利用。他的那须石头博物馆（2000年）就是一个很好的例子，以当地的石头打造了柔软多孔的墙，让光在其中穿梭。

隈研吾的其他著名建筑包括长崎县立美术馆（2005年），浅草文化旅游中心（2012）以及中国的长城公社（2002年）。近年来，他还获得了来自欧洲和北美的数量不断增加的委托，包括巴黎地铁站，波特兰日本花园，邓迪的新V＆A设计博物馆，温哥华摩天大楼和位于欧登塞的安徒生博物馆。同时，在经过反复争论后，他被委托设计为2022东京奥运会而建新的国家体育场。尽管拥有这些这些著名项目，隈研吾仍专注于于小规模的设计委托，如私人住宅和店面，尤其是2011年的日本地震和海啸后。